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CGC——全球线虫科研工作者的共同家园

2019-08-08 17:35

CGC的全称是Caenorhabditis Genetics Center,是一家为全球线虫科研工作者提供收集,保存,分享重要线虫虫株服务的平台。

从1970年开始,生物学家们逐渐认识到秀丽隐杆线虫是一种非常重要的模式生物。实验室之间如果可以互相分享秀丽隐杆线虫虫株,将对整个线虫社群发展起到积极的推动作用。同时,如果重要线虫的虫株能得到集中储存,就可以缓解不同实验室同时保管大量不同虫株的压力,并保护线虫免受丢失风险。让具有不同遗传特征的线虫的获取、储存、分享更简单便利,将加速促进线虫(C.elegans)研究社群的壮大。

在这样的背景下,CGC应运而生。1979年,在美国密苏里州大学Donald Riddle博士的带领下,CGC开始营运。全球各地的实验室和研究者们都可以通过向CGC写信的方式索取虫株。由于美国国立卫生研究院(National Institutesof Health,NIH)的资金帮助,最早CGC是免费向科研人员提供线虫的。在第一年,CGC仅仅分享了15株线虫。但在之后的10年里,随着线虫研究逐步成熟,实验室对线虫的需求也逐年增加,CGC使得带有突变的线虫和转基因线虫得以便捷广泛地传播。截至1992年CGC迁离密苏里州大学,每年寄出的线虫数量已达1400余株。

 

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图1 CGC发展历程及历年分享出去的线虫数

MarkEdgley是CGC在密苏里州大学时任负责人之一。1992年,他租了一辆卡车,将CGC的1600株库存虫株冷冻在液氮中,驱车800多公里,将线虫从密苏里州运到了线虫的新家——明尼苏达州大学的圣保罗校区。同年,CGC的首任掌门人Riddle博士也将管理权移交给了Robert Herman博士。Herman博士就此也接过了CGC的管理权。Herman博士于2007年退休,他掌管CGC的15年,是CGC与线虫研究社群迅速壮大的时期。15年间,由线虫科研工作者分享到CGC的线虫均以每年增加700余株的数量增长,每年由CGC寄往全球的线虫数量上升至7500株。

2007年6月,Ann Rougvie博士接过Herman博士的班,开始担任CGC的负责人。那年,NIH开始向用户收取一定的费用以支持CGC的日常营运花销。这也是CGC向用户收取象征性的小额线虫费用之外,开始向用户收取注册费用的元年。在当年的国际线虫大会上,CGC宣布了这一新政,引发了台下线虫研究者的一片哗然。CGC也迎来了创始之后的第一次分享数量下跌。然而随后,线虫学者们还是无奈地接受了这一收费政策,从CGC寄往全球的线虫数量又开始触底反弹。2013年,CGC发出的线虫数量达到了史上最高的31242株。而单日寄出的最高记录则发生在2009年1月20日,那天,共有619株虫离开了明尼苏达州!其后,CGC发送的线虫数量保持相对稳定,每年寄出的线虫约为3万余株,每个工作日约有115株线虫从明尼苏达州发往全球各地。

过去25年间,CGC平均每个订单索取的线虫数量为4株左右。而史上最大的订单量是发生在2009年的3894株线虫。CGC虫库中已有超过90%的线虫都参与了分享转寄。近年来,虽然也不断有新的基因表型被增加到线虫虫库中,但研究者对经典表型线虫的需求始终长盛不衰。


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图2 2017-2019年间需求最大的前10株线虫(CGC提供数据)

上源生科于2019年6月在UCLA参加第22届国际线虫大会,带回来CGC部分简报信息,与大家分享。全球共有6246家实验室在CGC注册,遍布75个国家。值得关注的是,在CGC 2017-2019年的十大用户中,就有4个来自中国的线虫实验室。目前在CGC注册的中国实验室已超过100家且每年都在持续增长。可见线虫研究在中国已经星火燎原,方兴未艾!

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图3 全球线虫研究实验室数目(CGC提供数据)

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图4 2017-2019年间需求线虫最多的前10位研究者(CGC提供数据)

作为线虫研究大家庭的一份子,上源生科在CGC注册了自己的线虫名和等位基因名代号,分别为PHX和syb,大家在论文中看到线虫名以PHX开头和或等位基因名以syb开头的线虫,就知道是这株线虫是来自上源生科编辑的啦!CGC已经收录了三株上源生科生产的线虫,另外还有70余株已发表的上源生科生产的线虫没有被收录到CGC。

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图5 上源生科生产的三株被CGC收录的线虫

  另外,上源在这次22届世界线虫大会的 UCLA现场有幸与CGC现任掌门人Ann Rougvie博士以及日常负责人Aric Daul会面,并共同探讨如何更好促进中国线虫研究者在CGC购虫的相关事宜。

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图6 上源胡总与来自CGC的AnnRougvie、Aric Daul合影