Strain Name | PHX1446 |
Genotype | nlp-8(syb762) I; nlp-32(syb431) cnc-6(syb393) III; Y43C5A.3 (syb761) IV; nlp-25(syb579) cnc-10(syb937) cnc-7(syb558) sybDf1 sybDf2 V |
Description | PHX1446 carries knockouts of 19 members of the nlp and cnc peptide families.
sybDf1 is a deletion of a gene cassette including nlp-34, nlp-31, nlp-30, nlp-29, nlp-28, and nlp-27.
sybDf2 is a deletion of a gene cassette including cnc-11, cnc-1, cnc-5, cnc-4, cnc-3, and cnc-2.
syb762 is null allele with the whole gene of nlp-8 deleted.
syb431 is null allele with the whole gene of nlp-32 deleted.
syb393 is null allele with the whole gene of cnc-6 deleted.
syb761 is null allele with the whole gene of Y43C5A.3 deleted.
syb579 is null allele with the whole gene of nlp-25 deleted.
syb937 is null allele with the whole gene of cnc-10 deleted.
syb558 is null allele with the whole gene of cnc-7 deleted.
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Wild type Sequence | >wild type 1
ttttaaagtatattcgtcagcagcagaaatCTATTTTCCCCATCCGTATCCATATGGGCGGTATCCCCATGGGCGGTAGTATGGGCGGCGCCATCCTCCGTATCCTCCGTATCCGTACGGGCGGTctgaatcgaaaaattgcaggtacttgtcaaattttagtaaacttacATCCATATCCCCATTGAGCTTCAGCGACGGCCAACAGGCAAGCGATGAGGAGAAGGACAATGAAGAAGAGCTTGGCGGAAATCATgattctggaaattgaaaactatggcatcccaatttttgttaatcgtgtaaaaatagggagaccccttgagataatcatgagaaactgtcagaaaattttagagatgtatgtattgacctttggtgacgtaattcgcaacatggatagtactatctagtaggtcaaaaatcatcaagggcacatgtgaattgaaaaatgtctaccaatgaaaaattggtgtatggtctacgtctaggtacgtctaggtctaggtaggtctaggtttaggtaggtctaggtctaggtaggaataggtctaggtatgtcaggtataataggtatgtatatgtaaaataagactaacaatgcattttttgaatttttaagagatgtttgtagacaaagtctttgagagatccgaaactgtcaaaataaaaattagaaagtttagagcaagttaaatattttctaaaataaattcagaaagtaaaagtgtttggtgtttttggaatccactttctagtacatctccaaagaaaaccaagccgaaaatgtgacttatctccctcattcccctccatatttatacgtcctcatctaacttgttcaccgaataatcgtcctcattcgtttccccgtcttcttctagtttctacctcgttttctctgatctatgacgctttctgatctttaattgtcgactccactctatcagtcccagttcttcgtgtcaccaccatcgttaccaaatgtgttattcggcgatcggcaagtgagagaagccgatttccccgaaagttttgtgattttgcccggcaatggattagtctgtttggtgaacagggatgaaaccgtgtagaccatcacacagtggttgatcttcttcgtgaccgcgtctgataagatagtgtgttggagtgagagagggagaagaaggaaaatggtttaatgatgtcattgtttctcgccaaaaagagatagtggagataagaatatctgatctataaaaagacaagtaaagtggcgaatattagaaaactcatattcttgatattctacaatcaataacaATGATTTCAACTTCTTCAATTCTTGTTCTCGTCGTCCTTCTAGCCTGCTTCATGGCTGCCAATGCTCAATGGGGATATGGTGGATATGGAAgtaagttttatgatagatattaattttttgaattccacctagttaaacagtttaatttttaattttagtttgttttctaagttgaactacattctttacaatataatttatttccagGAGGTTATGGAGGATATGGTGGATACGGTAGAGGCTACGGTGGATATGGTGGATATGGACGTGGGTATGGAGGCTATGGACGTGGAATGTATGGAGGATATGGTCGCCCATATGGAGGATACGGATGGGGAAAGTAAaagcatagacgagtcaactcgcatccgatactcaaattttgttaatttatgctccttgtacatatattgaactctaatttaatgaaaatctatctatgatacacttgagaacattgttgttcgtacattttttcactgtaaatttgttccaattagaatggaacaaaacccaacggagataacgtgtaacagtaaaattagatcaaggacaacatgttcttaactgttggcattttagagaggagtatgatctgattttcgttcactcttattgtttttcatgtgagctgataatctatttaaacgttcaaatgattgcagactgtgccaaattttgagcagagaaatttccccttgtgtttcactagaggtggagtattggcagttaggattcaaccttaaaaagcttttaataatatgacatgaccgaaaatcttattaaaacattctaaaacatttagatttttacaaaatttttcagtaagcattttgatgaatgtcaaatttcataaaatgtcgactttttgaataatttcgagcattgctgtaggtttgaaagccaacgatgtttgaatacaaacaaacaaagcacactgaaagtagggctaccacggtacgtagacgcatcgaggcgaaaggtaggtggaggtcaggcaggcagatattttaacccttacatgaaagccctaattgaaagtacgaagttcgtttaacaagcaatttttggtcggcttcaaaactatgaaaagtgaaaactgagttctcagcactttttggctctaaaaaaattgattcaaaaaacggctttgaacagcttccgtaataaaaatactcaacttttaattgtgccatgcaactgatgaattttttttgaatgatgattttcaagcaaatttaaattgacatgcttataatgaatattctgaatttttcggttttattcgagaggtttaaaatttttcaatttttaacgcattgtccaaacattccttttctgattcatgtgaccattttgtaatttgatcctttatcacgatgatgttccttttttctttttttctaacaaagctgaaaacaagttgagtttttgtttgatgggagatgtataatgaattggtctcaaacttttaaaattttaggggattccggtattgaatttgtttattcttaatttttcgcatagtgaaatagtgaaaaagagaaaattcattttctgcaagaagattagtttagatgattacaagcacattttttctgaattccaagtttgaatcaaatatgtgtagtttttaaaagtaggaatagaagaccaacctgttcaaatgtgtcaaatgaagacagacatcaaaaacaccttttcttaaaaatttccttgaaatgaaattgtaaacaacttttaaagttcaaaaatatcaatcaatgatattttatggtttcaaataactaaaaaaaccacgaaagcgatgagcgcactttccagatcaaatatatttcatttcctagaaaaaagctgtgtttttctaaatcgttcgaaagtccaaattatgtcaagcacggactgtgatagcttcaaaagtacaatcactgattatttgattataaattcagtgatcaatactttttaaacgcttcagtttttattacaattggttggaattgatctatattttattaagctttcaaatctgttcgtcgtataaggagagatatcagagggaaaagaaacagagtcttgtgatgatatcattttttgatcgccaaagagaaaattgaagatagtggaaatcttgtataaaagtcacaaaagctgtggaaaaaatcagaaagccatttgcttgatttttaaaataaaacaaaaaATGATTTCAACTTCTTCAATTCTGATTCTCGTTGTTCTTCTCGCCTGCTTCATGGCTGCCAGCGCCCAATGGGGATATGGAGGATATGGAAgtgagttttatacacatacaactgatcactcatagtttttttttctaggaggatatggtggatacggtggatatggtaGAGGTTATGGTGGATATGGACGCGGATATGGAGGTTATGGACGTGGAATGTGGGGACGCCCATACGGAGGATACGGATGGGGAAAGTAGattcatgaaaaatgatgctagtaatatttttgagaatctcattgccttatgaacctgtgcgttgtatattgatttcgacaacaccaataaataaattatttcatctattgtactatttacctagaagcatgcgttataaaatcatacaaaaaaacgaactgtcaggtgtaataaacacataacaaatattgaaaaaagaacgaattatgaaaatttatcctgatactttttggcagaaattaaggtaagcgcttacatttaattttagtgattttggttcaaaatgtagatctacggaagtgaacatgtggatttacggggtgaacatgtggatttacgggatgaacatgtggatttatgggagaacatgtgcatttacggagtaaatacatatatatgtttacaaggagcttgttttaaaaatatggaaaatgactatagatctacagaagtcaaatcaatgctgcatgtgaaatcgcaaaatttcgataacaaaaaaaacatgtttttcaaaactttgaaacgcaaaaattaggaaaatttaaaaacaatttattatgcataaatttccaaattttaagtttttttggaaataaaccttatatttgattgattcattaaaaatgcaagcagttcctttttacttctatgttgtttcaaactttggttagcgacacaaaaacaatcattggtcagaaatgttgcccataagacataaacgatattttgcctttcgaaatgagatatcaatgtaacctttagaaatcggtaaaaattggaaattgtgttttcagaagtcatattggtcagatgatcacagaaatcagaatgattagtttaccacagtgcggttaaaactaatgaaattttacaaaaatcttcaaaaaagagagtgaaataaatcatgtcaacacaggataatgtggcaaaaagatggaatggagtgcttgtaaaaacatacttttcaaaactttttcgtaatttttttagtttttctaaaataaagaataggcaatttttttttgaattcccgcgcaaatgaccagattcaacatttccgaattttctggctaaacacgttggttttttttcaattttgatattagatttgaagcacgcctgtcaaatgctcagacagcttaccgcagaaaatatataatttcagcattttctttttcggttatctagatttctccacgggaaaatgactgaaaaattgaaaaacggtgtttc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>wild type 2
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>wild type 3
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>wild type 4
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>wild type 5
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>wild type 6
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>wild type 7
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>wild type 8
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>wild type 9
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Mutant Sequence |
> sybDf1 nlp cassete deletion
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>sybDf2 cnc cassete deletion
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>cnc-6(syb393)
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>cnc-7(syb558)
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>cnc-10(syb937)
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>nlp-8(syb762)
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>nlp-32(syb431)
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>Y43C5A.3(syb761)
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>nlp-25(syb579)
tatcttcttttcccagatttttttttcaat-ttttaactacatgttttctgtataaaattg |
Phenotype |